Санитарно-эпидемиологическая служба, система гос. органов и учреждений, осуществляющих сан.-эпидемиологич. надзор, разработку и проведение сан.-профилактич. и противоэпидемич. мероприятий. В Уфим. губ. С.-э.с. как одна из структур земской медицины начала формироваться во 2-й пол. 19 в. В 1910 вводятся должности уездных и гор. сан. врачей. В соотв. с Декретом СНК РСФСР «О санитарных органах республики» (1922) создаются специализир. сан.-профилактич. учреждения, деятельность к-рых была направлена на борьбу с эпидемиями инфекционных болезней. К 1929 в респ. насчитывалось 38 сан.-эпидемиологич. учреждений. В 1933 пост. ВЦИК и СНК СССР в стране (в т.ч. и в БАССР) создана Гос. сан. инспекция. В 30—40-е гг. в Башкортостане ликвидированы натуральная оспа, холера, чума. К 1946 в респ. действовало 54 сан.-эпидемиологич. станции, 54 прививочных и 18 малярийных пунктов, 15 сан.-бактериол. лаб., 19 молочно-контрольных, пастеровская и дезинфекц. станции. В 1949—56 в результате объединения Гос. сан. инспекции с сан. -противоэпидемич. учреждениями была создана единая С.-э.с., в составе к-рой находились респ., гор. и районные комплексные сан.-эпидемиологич. станции (с 1989 центры сан.-эпидемиологич. надзора). В 60—70-е гг. ликвидированы малярия, трахома, эпидемич. полиомиелит. С 1969 в связи с развитием в респ. нефт. и хим. пром-сти осн. направлением деятельности С.-э.с. становится предупредит. и текущий контроль за проведением мероприятий, направленных на охрану здоровья населения и санитарную охрану окружающей среды. В 1994 под рук. Центра гос. сан.-эпидемиологич. надзора функционировало 67 гор. и районных центров. В респ. действуют Управление Федер. службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека в Республике Башкортостан (с 2005; рук. Р.М.Такаев) с 12 терр. отделами в гг. Белебей, Белорецк, Бирск, Кумертау, Нефтекамск, Октябрьский, Салават, Сибай, Стерлитамак, Туймазы, п.Чишмы, с.Месягутово (532 чел.) и Центр гигиены и эпидемиологии в Республике Башкортостан (гл. врач Г.Д.Минин) с 12 межрайонными филиалами (850 чел., 2008). С.-э.с. сотрудничает с Медицины труда и экологии человека институтом. Деят-сть С.-э.с. респ. осуществляется в соответствии с законом «О санитарно-эпидемиологическом благополучии населения Республики Башкортостан» (2006).