Эндемики – это специфические виды данной территории. П.Л. Горчаковский называет их «эмблемами флоры». Как уже отмечалось, они чаще имеют небольшие ареалы. Как правило, эндемики связаны с горными территориями, для которых характерно наличие изолированных местообитаний, и где активно протекают процессы видообразования. В Башкортостане большинство эндемиков также связано с горными и предгорными территориями. Тем не менее, флора Урала «…мало самобытна и формировалась главным образом под влиянием флор других, более или менее близких к нему областей с издавна сложившимся самобытным ходом развития» (Горчаковский, Шурова, 1982, с. 37).
В составе уральской флоры содержится сравнительно немного эндемиков (около 5,5 % общего числа сосудистых растений), причем эндемические формы представлены видами и подвидами. Ни одного эндемичного рода на Урале нет. Поскольку возможны разные трактовки вида (более широкая и более узкая), то при широкой трактовке вида большинство наших эндемиков окажутся внутривидовыми таксонами.
Большинство уральских эндемиков – это виды, которые в прошлом были распространены гораздо шире, а теперь находятся в состоянии угасания и сохранились в немногих местах с особыми эдафическими условиями. П.Л. Горчаковский считает, что на Урале широко выражен реликтовый эндемизм, и различает три основных группы эндемиков.
Высокогорные эндемики. Эта группа наиболее многочисленна, она формировалась под влиянием многих факторов: подъема уровня поверхности (эпейрогенеза) в конце третичного – начале четвертичного периодов; образования новых видов из исходных форм, которые в плейстоцене проникли на Урал из других горных областей; возникновения новых видов в результате отбора из приближенных к горам низинных местообитаний; процессов межвидовой гибридизации и апомиксиса.
Высокогорными эндемиками во флоре Башкортостана являются овсяница Игошиной ( Festuca igoschiniae ), ветреница пермская ( Anemonastrum biarmiense ), родиола иремельская ( Rhodiola iremelica ), качим уральский ( Gypsophila uralensis ), ясколка Крылова ( Cerastium krylovii ), лаготис уральский ( Lagotis uralensis ), горькуша уральская ( Saussurea uralensis ), ястребинка иремельская ( Hieracium iremelense ), ряд видов рода манжетка ( Alchemilla ) и др.
Горно-степные и скальные эндемики. К этой группе относится большинство эндемиков флоры Башкортостана. Эти виды возникли в древних доледниковых горных каменистых степях в ходе эволюции видов, которые в периоды потепления климата мигрировали на Урал из Крыма, Кавказа, гор Средней Азии, из Восточной Сибири, с Русской равнины и даже из Европы. Некоторые эндемики возникли в результате гибридизации. Большую роль при этом сыграло то, что в плиоцене в южной части Урала на южных щебнистых склонах существовали разреженные сообщества травянистых ксерофитов, приспособленных к обнажающемуся субстрату. На этих обнажениях в открытых сообществах с пониженным уровнем конкуренции находили благоприятные местообитания мигранты из других районов.
Примеры горно-степных и скальных видов-эндемиков: пырей отогнутоостый ( Elytrigia reflexiaristata ), тонконог жестколистый ( Koeleria sclerophylla ), минуарция Гельма ( Minuartia helmii ), м. Крашенинникова ( M. krascheninnikovii ), гвоздика иглолистная ( Dianthus acicularis ), г. уральская ( D. uralensis ), лен уральский ( Linum uralense ), лапчатка Эверсманна ( Potentilla eversmanniana ), астрагал Карелина ( Astragalus karelinianus ), остролодочник Гмелина ( Oxytropis gmelinii ), о. сближенный ( O. approximata ), копеечник Разумовского ( Hedysarum razoumovianum ), к. серебристолистный ( H. argyrophyllum ), пижма уральская ( Tanacetum uralense ) и др.
Эндемики лесов. Эта группа видов менее многочисленна и в основном связана с обособлением широколиственных лесов Урала при похолоданиях климата в плейстоцене. К ним относятся: чина Литвинова ( Lathyrus litvinovii ), короставник татарский ( Knautia tatarica ) , цицербита уральская ( Cicerbita uralensis ). Гибридогенное происхождение имеет ветреничка уральская ( Anemonoides uralensis ), растущая в пойменных лесах и лугах на северо-востоке республики (реки Ай, Юрюзань и др.).
